Autogamie

Dans une population naturelle de plantes hermaphrodites, on s'intéresse au locus biallélique $val6. L'analyse d'un très gand échantillon a permis d'estimer les fréquence génotypiques suivantes:

Sachant que pour chaque plante $val10 % des fécondations se fait en autogamie, quelles seront les fréquences attendues des différents génotypes dans la descendance des plantes de chaque génotype ?

Indiquez maintenant les fréquences attendues à partir de l'ensemble de la population :

Les réponses sont attendues avec un arrondi au millième. Vous devez arrondir chaque nombre individuellement même si la somme globale est légèrement différente de 1.

Dérive1

Hardy Weinberg 1

Dans une population, on observe pour un gène $val7 les effectifs génotypiques suivants sur $val10 individus échantillonnés :

La fréquence estimée de l'allèle $(val8[1]) est $(val15[1]).

• Calculez les effectifs génotypiques attendus si la population est à l'équilibre de Hardy-Weinberg.
• Reportez vos résultats dans le tableau.

Hardy Weinberg freq

Dans une population, on observe pour un gène $val7 les effectifs génotypiques suivants sur $val10 individus échantillonnés :

• La fréquence estimée de l'allèle $(val8[1]) est $(val15[1]).
• Calculez les fréquences génotypiques observées.
• Calculez les fréquences génotypiques attendues si la population est à l'équilibre de Hardy-Weinberg.
• Reportez vos résultats dans le tableau puis répondez à la question suivante :

Test de conformité à Hardy Weinberg

Dans une population, on observe pour un gène $val7 les effectifs génotypiques suivants sur $val10 individus échantillonnés :

La fréquence de l'allèle $(val8[1]) a été estimée à $(val15[1]) $val42.

On cherche à tester si la population est aux proportions de Hardy-Weinberg.

• Calculez les effectifs génotypiques attendus sous cette hypothèse et reportez vos résultats dans le tableau
• Quelle est la valeur du Chi2 ?
• Quel est le nombre de degrés de liberté ?
• La probabilité associée à cette valeur de Chi2 est-elle ? .
• Qu'en concluez-vous ? .

Homozygotie et consanguinité

Migration

On s'intéresse à deux populations naturelles partiellement isolées. Ainsi la population I est constituée à chaque génération d'une proportion $val12 d'individus issus de la population II, le reste des individus étant issu de la reproduction de la population I. De même, à chaque génération une proportion $val13 d'individus de la population II provient de la population I.

A la génération n, les fréquences alléliques ont été déterminées pour un locus autosomal $val6 et pour chacune des 2 populations :

Quelles seront les fréquences de l'allèle $(val7[1]) à la génération suivante dans chacune des 2 populations ?

Migration et écart de fréquences alléliques

On s'intéresse à deux populations naturelles partiellement isolées. Ainsi la population I est constituée à chaque génération d'une proportion $val12 d'individus issus de la population II, le reste des individus étant issu de la reproduction de la population I. De même, à chaque génération une proportion $val13 d'individus de la population II provient de la population I.

A la génération 0, les fréquences alléliques ont été déterminées pour un locus autosomal $val6 et pour chacune des 2 populations :

Calculez l'écart de fréquence allélique entre les deux populations :

Ecart initial entre les fréquences alléiques : $val15

Panmixie

Une population de $val6 est constituée à partir d'individus collectés dans des localités éloignées. Les fréquence génotypiques dans cette population artificielle pour un locus biallélique $val7 sont les suivantes:

On laisse cette population se reproduire en panmixie. Quelles seront les fréquences des différents génotypes à la génération suivante ?

Après une génération supplémentaire :

• les fréquences génotypiques auront-elles évolué ?
• les fréquences alléliques auront-elles évolué ?

Allèle à génotype

Dans une population naturelle, on s'intéresse à un locus biallélique présentant les allèles $val7 et $val8. A partir des fréquences génotypiques observées, on a pu déduire la fréquence allélique de $val7 : $val15. Sachant que $val13, déduisez-en quelles étaient les fréquences génotypiques observées.

Fréquences

On vous demande si vous pouvez estimer la fréquence allélique de l'allèle $val7 sans faire d'hypothèse.

Calcul de fréquences

Dans cette population, on observe les effectifs phénotypiques suivants :

On vous demande si vous pouvez estimer la fréquence allélique de l'allèle $val7 sans faire d'hypothèse.

Fréquences cas réels

$val8

Dans cette population, on observe les effectifs phénotypiques suivants.

On vous demande si vous pouvez estimer la fréquence allélique de l'allèle $(val9[1]) sans faire d'hypothèse.

Fréquences cas réels 2 allèles codominants

$val8

On cherche la fréquence de l'allèle $(val9[1])

Dans cette population, on observe les effectifs phénotypiques suivants.

Fréquences 3 allèles ou plus

Dans une population, on observe pour un gène $val8 les effectifs génotypiques suivants.

Le nombre de fréquences à calculer est $val7. Calculez ces fréquences et indiquez les dans le tableau ci-dessous :

Coefficient de consanguinité 1

$val6

$val8	$val9

Coefficient de consanguinité 2

$val6

Coefficient de consanguinité 3

$val6

Coefficient de consanguinité 4

$val6

Coefficient de consanguinité 5

$val6

Coefficient de consanguinité 6

$val6

Coefficient de consanguinité

$val10

croisement contrôlé

$val8

On s'intéresse aux individus issus du croisement entre un individu femelle de phénotype $(val12[$val13]) $val27 et un individu mâle de phénotype $(val12[$val14]) $val28

Couples

Dans une population naturelle on s'intéresse à la formation des couples. On a échantillonné $val10 couples et regardé le génotype de chacun des deux partenaires au locus $val7. Les effectifs observés pour les différentes associations sont les suivants :

Sous cette hypothèse, chacun des partenaires du couple est choisi au hasard parmi les génotypes possibles.

Formation aléatoire des couples : test

Dans une population naturelle on s'intéresse à la formation des couples. On a échantillonné $val11 couples et regardé le génotype de chacun des deux partenaires au locus $val8. Les effectifs observés pour les différentes associations sont les suivants :

Les réponses sont attendues avec une précision d'un centième

Calculez les effectifs attendus si les couples se forment au hasard et indiquez-les dans le tableau ci dessus.

• Quelle est la valeur du Chi2 ? $m_reply10.
• La probabilité associée à cette valeur de Chi2 est-elle ? $m_reply11.
• Qu'en concluez-vous ? $m_reply12
• Quel régime de reproduction pourrait expliquer les effectifs observés ? .

Descendance

Dans une grande population de plantes à sexes séparés, on a observé un locus $val9 ayant deux allèles $val10 et $val11. L'allèle $val10 a une fréquence de $val8. On suppose que la reproduction se fait de façon panmictique dans cette population.

On s'intéresse aux individus issus $val21.

Gène lié au sexe

On étudie une population où les femelles sont homogamétiques XX et les mâles hétérogamétiques XY. On s'intéresse à un gène $val6 lié au sexe ce qui signifie qu'il est porté par le chromosome X. A ce locus, deux allèles sont détectés : $val7 et $val8. $val13.

On observe les effectifs phénotypiques suivant :

Mutation 1

Mutation 2

Phénotypes

Phénotypes cas réels

$val8

Sélection

On s'intéresse à une population naturelle qui se reproduit par panmixie. Une étude de la survie et de la reproduction a montré que la valeur sélective des individus différait selon leur génotype au locus biallélique $val6. L'analyse d'un très gand échantillon a permis d'estimer les fréquence génotypiques et le valeurs sélectives suivantes :

A partir de ces informations, calculez les fréquences génotypiques attendues à la génération suivante :

Sélection équilibre

• Compte-tenu de ces informations, existe-t-il un équilibre polymorphe?
• Indiquez la fréquence d'équilibre de l'allèle $(val7[1]) (si un équilibre polymorphe est attendu vous devez indiquer celle-ci) :
• La situation d'équilibre indiquée est-elle stable ?